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通過準確測量 hPSC 的基因表達譜來表征 hPSC，以確定它們在從初始到引發多能性范圍內的狀態。
qPCR 用于確定多個樣品中基因表達的穩態 mRNA 水平的變化，通常歸一化為內部對照基因的相對表達。基因特異性引物可擴增從 mRNA 逆轉錄的 cDNA 庫中的靶序列，并且與 TaqMan® 技術一樣，雜交序列特異性探針提供來自 Taq DNA 聚合酶的 5' 核酸外切酶活性的熒光信號。熒光信號的積累速率用于定量樣品 cDNA，從而定量原始細胞裂解物中 mRNA 的量。
人多能干細胞 （hPSC） 幼稚狀態 qPCR 芯片已驗證引物和探針，可檢測 90 個預選基因，這些基因在初始狀態和引發的 hPSC 及其衍生物中已證實的差異表達，以及 6 個內源性對照基因。TBP（TATA 盒結合蛋白）qPCR 對照模板作為合成 DNA 陽性對照提供。初始狀態的 hPSC 是自我更新的，保留了植入前囊胚的特性，并且可以分化為胚胎和胚胎外譜系。引發的 hPSC 也是自我更新的，但它們僅限于沿三個胚胎胚層的分化。其他基因信息和 qPCR 分析工具
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